Programul Operațional Regional are două categorii principale de beneficiari: autoritățile locale și firmele (IMM). La acestea se adaugă lăcașuri de cult, autorități centrale, spitale, precum și unele direcții și instituții deconcentrate. Cele mai mari proiecte sunt implementate de către autorități (13 proiecte au o valoare fiecare de peste 100 milioane lei), în timp ce cel mai mare proiect privat ajunge la 55 milioane lei (un centru de afaceri IT în parcul industrial Miroslava, Iași).